Esta parte se realiza mediante punción transvaginal guiada por ecografía. Normalmente, se utiliza una sedación suave para que la mujer no sienta dolor. Cuando está dormida, se introduce la sonda del ecógrafo por la vagina. Esta sonda lleva montada una guía metálica, a través de la cual se introduce la aguja de punción.

os óvulos son demasiado pequeños para ser vistos en la ecografía. Lo que vemos son los folículos (dentro de los cuales están los óvulos). Para la recuperación de los óvulos, se localizan los folículos en los ovarios, y se procede a pincharlos.

Cuando se pincha el folículo, se aspira su contenido (dentro del liquido aspirado se encuentra el ovulo) con una bomba de aspiración, y el líquido obtenido se entrega inmediatamente a los biólogos en el laboratorio de FIV (que suele estar contiguo a la sala de punciones), quienes buscaran los óvulos al microscopio.